Marcatori DNA barcoding impiegati per il
DNA Verity
TEST®
DNA plastidiale (cpDNA)
Parte
variabile del gene della subunità maggiore della RuBiSCO (rbcL) + parte variabile del gene maturasiK (matK) o spaziatore intragenico del psbA-
trnH(GUG).
DNA nucleare (nrDNA)
Secondo spaziatore interno
trascritto della DNA ribosomale (ITS2).
Descrizione del Servizio DNA Verity
TEST®
(A) estrazione del DNA da differenti tipologie di
matrici (2) in cui si presume la presenza di DNA vegetale di piante superiori o da tessuti vegetali in cui non è possibile risalire alla specie;
(B) amplificazione e sequenziamento con chimica Sanger da uno a tre (3) parti specifiche del DNA definite marcatori DNA barcoding
approvati dal Consortium for the Barcode of Life (CBOL, 2009; iBOL, 2021) per la
caratterizzazione tassonomica della/e specie presente nel campione;
(C) confronto con banche dati di DNA
internazionali (BOLD e GenBank) ed aziendale che permettano di rilevare la natura tassonomica delle
specie/generi presenti e/o i livelli di contaminazione.
(1), l’identificazione della specie avviene in funzione dei dati di sequenza presenti nelle banche dati internazionali (vedi punto C). Per cui nell’eventualità, seppur rara, della mancanza della specie in banca dati, la caratterizzazione potrà essere a livello superiore di specie (p.es. genere). Inoltre l'identificazione della specie dipende anche dalla variabilità intrinseca dei marcatori utilizzati e questo può comportare che talvolta si possa circoscrivere il risultato non ad una sola entità specifica.
(2), quantitativo analizzato può essere anche pari a pochi milligrammi (ad esempio, da 5 a 250 mg a campione a seconda dello stato di idratazione). Per quantitativi diversi, si può prevedere un preventivo personalizzato.
(3), il numero può variare in funzione dei risultati ottenuti.
Spedizione dei campioni
Si può utilizzare il ritiro in sede se
risiedi in Campania attraverso il nostro corriere (#DNATechExpress) con un
piccolo costo aggiuntivo da concordare in funzione della distanza (25 -EURO per Napoli; 35 -EURO in provincia di Napoli e Caserta; IVA esclusa).
Costi & Tempi
Contattaci per un preventivo o per avere maggiori informazioni sul nostro servizio. Infatti, a causa della complessità di alcune matrici, ci si riserva un preliminare studio sulla matrice da indagare per valutare la fattibilità dell'analisi e dei costi.
Nei casi in cui non si vada oltre la fase di amplificazione verrà addebitato solo il costo delle attività svolte, pari a 60 -EURO (IVA escl.)
a campione.
A seconda
dell’arrivo del campione presso il nostro laboratorio, considera da 2 - 4 settimane per l'invio dei risultati per posta elettronica. Per valutare le tempistiche per il processamento di volumi importanti
di campioni si invita a contattarci preventivamente.
