Sede Operativa: Via Foria 223 - Orto Botanico, 80139 Napoli
Sede Legale: Via F. Caracciolo 15, 80122 Napoli
P.IVA: 08984051212 Cod.ATECO: 72.11.00
Italia
Copyright © 2018 DNATech Srl. Webmaster: Olga De Castro
Identificazione di organismi vegetali attraverso il DNA barcoding
(#DNABarcodingservice - DNA Verity TEST® )
Il SERVIZIO consiste nell’identificazione molecolare tramite chimica Sanger, del DNA da campioni vegetali da matrici di diversa natura. DNA Verity TEST® (DVT) risulta essere un protocollo standardizzato che determina un test molecolare rapido ed attendibile in grado di caratterizzare e/o confermare la singola specie vegetale (1) presente nella matrice analizzata.
Nota bene, per campioni misti, in cui si presume un numero di specie vegetali superiore ad una, questa tecnica non risulta idonea, seppure può essere fondamentale per valutare in prima analisi se il campione è puro o presenta altre entità vegetali oltre quella certificata.
Per valutare la presenza di più campioni vegetali nella matrice, altri approcci diagnostici devono essere utilizzati come dalla analisi di frammenti attraverso elettroforesi capillare (Genotyping), clonaggio (chimica Sanger) o dal DNA metabarcoding (chimica HTC, High-Throughput Sequencing). Per avere maggiori informazioni sui tipi di analisi che si possono integrare nel DVT e i relativi costi, contattaci.
Marcatori DNA barcoding impiegati per il DNA Verity TEST®
Parte variabile del gene della subunità maggiore della RuBiSCO (rbcL) + parte variabile del gene maturasiK (matK) o spaziatore intragenico del psbA- trnH(GUG).
Secondo spaziatore interno trascritto della DNA ribosomale (ITS2).
Descrizione del Servizio DNA Verity TEST®
(A) estrazione del DNA da differenti tipologie di matrici (2) in cui si presume la presenza di DNA vegetale di piante superiori o da tessuti vegetali in cui non è possibile risalire alla specie;
(B) amplificazione e sequenziamento con chimica Sanger da uno a tre (3) parti specifiche del DNA definite marcatori DNA barcoding approvati dal Consortium for the Barcode of Life (CBOL, 2009; iBOL, 2021) per la caratterizzazione tassonomica della/e specie presente nel campione;
(C) confronto con banche dati di DNA internazionali (BOLD e GenBank) ed aziendale che permettano di rilevare la natura tassonomica delle specie/generi presenti e/o i livelli di contaminazione.
(1), l’identificazione della specie avviene in funzione dei dati di sequenza presenti nelle banche dati internazionali (vedi punto C). Per cui nell’eventualità, seppur rara, della mancanza della specie in banca dati, la caratterizzazione potrà essere a livello superiore di specie (p.es. genere). Inoltre l'identificazione della specie dipende anche dalla variabilità intrinseca dei marcatori utilizzati e questo può comportare che talvolta si possa circoscrivere il risultato non ad una sola entità specifica.
(2), quantitativo analizzato può essere anche pari a pochi milligrammi (ad esempio, da 5 a 250 mg a campione a seconda dello stato di idratazione). Per quantitativi diversi, si può prevedere un preventivo personalizzato.
(3), il numero può variare in funzione dei risultati ottenuti.
Spedizione dei campioni
Si può utilizzare il ritiro in sede se risiedi in Campania attraverso il nostro corriere (#DNATechExpress) con un piccolo costo aggiuntivo da concordare in funzione della distanza (25 -EURO per Napoli; 35 -EURO in provincia di Napoli e Caserta; IVA esclusa).
Costi & Tempi
Contattaci per un preventivo o per avere maggiori informazioni sul nostro servizio. Infatti, a causa della complessità di alcune matrici, ci si riserva un preliminare studio sulla matrice da indagare per valutare la fattibilità dell'analisi e dei costi.
Nei casi in cui non si vada oltre la fase di amplificazione verrà addebitato solo il costo delle attività svolte, pari a 60 -EURO (IVA escl.) a campione.
A seconda dell’arrivo del campione presso il nostro laboratorio, considera da 2 - 4 settimane per l'invio dei risultati per posta elettronica. Per valutare le tempistiche per il processamento di volumi importanti di campioni si invita a contattarci preventivamente.
In aggiunta, abbiamo sviluppato e registrato il marchio DNA Verity TEST® che potrà essere anche riportato sulle confezioni dei prodotti analizzati aggiungendo valore al prodotto stesso essendo una certificazione di qualità e sicurezza per il consumatore (per informazioni, clicca qui o contattaci).
Un esempio dell’APPLICAZIONE del DNA Verity TEST® .
Cosa c'è nella tua tazza di tè? (De Castro et al. 2017).
Ad oggi gli infusi acquosi (tisane), ossia preparati con piante essiccate (foglie, frammenti e polveri) vengono ampiamenti utilizzati dai consumatori per diverse proprietà benefiche sia di natura fisiologica che farmacologica. Un’accurata definizione dei composti presenti nelle confezioni risulta essere molto importante sia per il consumatore ma anche per le aziende produttrici e per le autorità di controllo. A causa della natura frammentaria del composto vegetale non è spesso possibile identificare la specie di appartenenza descritte nella confezione.
In questo caso si è applicato il DNA Verity TEST® che è stato in grado di caratterizzare e confermare la tipologia di specie vegetale presente nelle tisane di tè verde/nero vendute sul mercato italiano. Dai risultati ottenuti si è osservato che un paio di aziende non hanno fornito prodotti autentici (presenza di contaminanti e/o assenza alcuni degli ingredienti elencati nell’etichetta).
Per leggere il lavoro completo clicca qui o se hai curiosità contattaci ad info@dnatech-spinoff.it
Referenze
De Castro et al. 2017. What is in your cup of tea? DNA Verity Test to characterize black and green commercial teas. PLoS ONE 12(5): e0178262.
Hollingsworth P.M. 2011. Refining the DNA barcode for land plants. Proc Natl Acad Sci USA 108 (49) 19451-19452.
iBOL. 2021. International Barcode Of Life. DNA Barcoding. A tool for specimen identification and species discovery. https://ibol.org/about/dna-barcoding/ (accesso Aprile 2021).
Kress W.J. 2017. Plant DNA barcodes: Applications today and in the future. J Syst Evol. 55: 291-307.